Un tiers des cerfs américains sont infectés par Covid – et ils ont infecté des humains au moins 3 fois – Ars Technica

Aux États-Unis, des personnes ont propagé le coronavirus contagieux au cerf de Virginie au moins 109 fois, et les animaux ont largement propagé le virus entre eux, un tiers des cerfs montrant des signes de pré-infection, selon un grand gouvernement – étude dirigée. Les travaux suggèrent également que les ruminants omniprésents ont renvoyé le virus à l’homme au moins trois fois.

Les résultats, annoncés cette semaine par le département américain de l’Agriculture, sont cohérents avec des recherches antérieures montrant que le cerf de Virginie peut facilement attraper le SRAS-CoV-2 des humains et le transmettre les uns aux autres, et basés sur au moins un cas dans Canada, le virus peut être transmis à l’homme.

Mais reste Une nouvelle étude, dirigé par le Service d’inspection de la santé animale et végétale (APHIS) de l’USDA, fournit une image plus large de la dynamique de transmission du cerf aux États-Unis et soulève finalement des inquiétudes quant au fait que le cerf de Virginie pourrait être un réservoir potentiel de virus. Autrement dit, les populations de cerfs communs peuvent acquérir et héberger des lignées de virus SARS-CoV-2 qui s’adaptent à leurs nouveaux hôtes et se retransmettent aux humains, provoquant de nouvelles vagues d’infection. Il est concevable que les virus passant du cerf à l’homme puissent parfois être qualifiés de nouvelles variantes, capables de contourner nos défenses immunitaires construites à partir d’infections et de vaccins passés.

« Les cerfs entrent constamment en contact avec les humains et se trouvent couramment dans les environnements humains – près de nos maisons, de nos animaux domestiques, des égouts et des ordures », a déclaré le Dr. Chiu-Feng « Henry » Wan est un expert des maladies infectieuses émergentes à l’Université du Missouri. Comme indiqué dans la thèse. « Le potentiel du SRAS-CoV-2, ou de toute maladie zoonotique, à persister et à évoluer dans les populations d’animaux sauvages peut poser des risques uniques pour la santé publique. »

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Entre fin 2021 et 2022, l’USDA, avec des chercheurs et des partenaires d’État, a interrogé 11 000 cerfs de Virginie de 26 États et de Washington, DC. Parmi ceux-ci, 31,6 % avaient des anticorps indiquant une infection antérieure par le SARS-CoV-2, et 12,2 % avaient un virus SARS-CoV-2 détectable.

Pour une autre partie de l’étude, les chercheurs ont collecté environ 9 000 échantillons d’haleine de cerfs dans 26 États et à Washington, DC, de fin 2021 à début 2022, et ont séquencé les génomes viraux de près de 400 virus SARS-CoV-2 qui ont ensuite été isolés. L’analyse évolutive des séquences de gènes a suggéré au moins 109 événements de propagation des humains aux cerfs, d’où il existe des preuves de transmission aux cerfs. Les virus trouvés chez les cerfs sont répartis sur plusieurs types courants chez l’homme, notamment les virus alpha, gamma, delta et omicron. Les données ont également trouvé des preuves de changements génétiques spécifiques aux cerfs lorsque les virus du SRAS-CoV-2 se déplacent d’un cerf à l’autre.

Enfin, les données génétiques ont suggéré trois retombées de virus SARS-CoV-2 adaptés aux cerfs vers les humains – deux en Caroline du Nord et une dans le Massachusetts. Pour cela, les chercheurs ont comparé les séquences du SRAS-CoV-2 du cerf avec des séquences de virus isolés chez l’homme, qui sont disponibles via des bases de données publiques. Dans les trois cas de débordement potentiels, les isolats de SRAS-CoV-2 d’origine humaine étaient identiques à plus de 99,9 % aux virus adaptés aux cerfs collectés sur des cerfs dans les États correspondants. Ces constatations ont été Il a été publié cette semaine par Wan et ses collègues dans Nature Communications.

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Depuis la collecte et l’analyse de ces données, l’APHIS a élargi la surveillance du SRAS-CoV-2 chez les cerfs. Actuellement, bien que les données continuent d’indiquer la possibilité que les cerfs puissent agir comme réservoir, rien ne prouve qu’ils jouent un rôle important dans la transmission du SRAS-CoV-2. Il existe de nombreuses inconnues que les chercheurs tentent de résoudre, y compris comment se produit exactement la transmission de cerf à humain et d’homme à cerf.

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